Protein–RNA interactions for Protein: Q96CT7

CCDC124, Coiled-coil domain-containing protein 124, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC124Q96CT7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CCDC124Q96CT7 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms