Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SMARCE1Q969G3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms