Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
BHMTQ93088 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
BHMTQ93088 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.8 ms