Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NCSTNQ92542 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms