Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
C17orf47Q8NEP4 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms