Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AVL9Q8NBF6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms