Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
LINC00612Q8N6U2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms