Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDDC3Q8N4P3 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDDC3Q8N4P3 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HDDC3Q8N4P3 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HDDC3Q8N4P3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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