Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYT9Q86SS6 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SYT9Q86SS6 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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SYT9Q86SS6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYT9Q86SS6 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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