Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CHMP1BQ7LBR1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms