Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UBE2R2Q712K3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UBE2R2Q712K3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms