Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC141Q6ZP82 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms