Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TPTE2Q6XPS3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms