Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RWDD4Q6NW29 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RWDD4Q6NW29 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms