Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ATL3Q6DD88 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ATL3Q6DD88 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms