Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PHYHD1Q5SRE7 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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