Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCDC93Q567U6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms