Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HSD17B12Q53GQ0 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms