Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY52

ZIK1, Zinc finger protein interacting with ribonucleoprotein K, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIK1Q3SY52 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ZIK1Q3SY52 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms