Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CSPP1Q1MSJ5 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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