Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NPTX1Q15818 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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