Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SEC23BQ15437 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SEC23BQ15437 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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