Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NECTIN1Q15223 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
NECTIN1Q15223 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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