Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RFTN1Q14699 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN1Q14699 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
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