Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SEMA3AQ14563 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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