Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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GBX1Q14549 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GBX1Q14549 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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GBX1Q14549 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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