Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ERV3-1Q14264 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms