Protein–RNA interactions for Protein: Q14247

CTTN, Src substrate cortactin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNQ14247 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CTTNQ14247 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms