Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL4A6Q14031 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL4A6Q14031 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL4A6Q14031 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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COL4A6Q14031 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
COL4A6Q14031 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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