Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TUBA3CQ13748 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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