Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
ATRQ13535 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRQ13535 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRQ13535 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRQ13535 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
ATRQ13535 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
ATRQ13535 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
ATRQ13535 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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