Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XRCC4Q13426 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
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