Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SRSF6Q13247 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms