Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GRIK2Q13002 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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