Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FOXD4Q12950 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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FOXD4Q12950 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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