Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
STX4Q12846 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
STX4Q12846 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
STX4Q12846 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
STX4Q12846 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
STX4Q12846 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
STX4Q12846 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms