Protein–RNA interactions for Protein: Q12800

TFCP2, Alpha-globin transcription factor CP2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2Q12800 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TFCP2Q12800 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TFCP2Q12800 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms