Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RASGEF1BQ0VAM2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RASGEF1BQ0VAM2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms