Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CD47Q08722 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CD47Q08722 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CD47Q08722 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms