Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOX4Q06945 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SOX4Q06945 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms