Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABPAQ06546 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms