Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PRKCDQ05655 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms