Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE3AQ05086 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms