Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CAV1Q03135 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms