Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PLOD1Q02809 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms