Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POU5F1Q01860 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms