Protein–RNA interactions for Protein: Q01726

MC1R, Melanocyte-stimulating hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MC1RQ01726 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MC1RQ01726 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MC1RQ01726 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms