Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMAD3P84022 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms