Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CBX1P83916 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CBX1P83916 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms