Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRX1P78414 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRX1P78414 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IRX1P78414 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRX1P78414 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IRX1P78414 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IRX1P78414 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
IRX1P78414 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms